מי חמצן ברמה של מזון הוא חומר חיטוי בעל יעילות גבוהה ורחב טווח בסדר של חומרי חיטוי. כי זה לא משאיר שאריות מזיקות לאחר חיטוי ועיקור, זה הפך מזון בטוח, ירוק ובריא.
מולקולות הידרוקסיל במי חמצן ברמה של מזון ונגזרותיו יכולות לפעול ישירות על הממברנה המבנית החיצונית של חיידקים, להרוס את מחסום החדירות של חיידקים, ולהרוס את מערכת איזון החומרים בתוך החיידקים ומחוצה להם ולגרום למוות. מולקולות הידרוקסיל חינם של מי חמצן יכול להגיב ישירות עם חלבונים וחומצות גרעין של מיקרואורגניזמים, גורם המבנה שלהם להיהרס ולהוביל למוות.
מחקרים מצאו גם כי מוצרי הפירוק של מי חמצן יכולים לעכב את מערכת האנזימים החיידקיים ולהגיב עם חומצות אמינו בשרשרת החלבון האנזים.